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    Thermofisher Qubit dsDNA HS Assay Kit (Q32854)

    更新时间:2025-04-30      点击次数:193

    Thermofisher Qubit dsDNA HS Assay Kit (Q32854) 用户指南:高灵敏度核酸定量技术方案

    一、产品核心特性与检测原理

    1. 技术背景与试剂盒组成

    • 检测原理:基于荧光染料特异性结合双链DNA(dsDNA)的特性,通过PicoGreen染料与dsDNA结合后荧光信号增强数千倍,实现高灵敏度定量。

    • 试剂盒组成

      • DSDNA HS Assay Reagent(试剂A):200×浓缩液(1.25 mL),含PicoGreen染料;

      • DSDNA HS Assay Buffer(缓冲B):250 mL,用于稀释样品与试剂;

      • 标准品1(C组份):0 ng/μL dsDNA(TE缓冲液);

      • 标准品2(D组份):10 ng/μL dsDNA(TE缓冲液)。

    • 兼容性:适用于Qubit 2.0/3.0/4.0荧光计及荧光酶标仪,支持单次检测1-20 μL样品。

    2. 性能指标与优势

    • 灵敏度:可检测低至0.2 ng/μL(200 pg/mL)的dsDNA,线性范围10 pg/μL至100 ng/μL;

    • 特异性:对dsDNA的选择性>99%,不受ssDNA、RNA、蛋白质或盐离子干扰;

    • 准确性:与qPCR结果相关性R2>0.99,CV值<5%(50次重复实验);

    • 抗污染性:耐受1% SDS、500 mM NaCl、1 mg/mL BSA等常见污染物。

    二、典型应用场景与实验方案

    1. NGS文库定量与质控

    • 实验设计

      1. 提取DNA后,使用Qubit dsDNA HS Assay Kit定量文库浓度;

      2. 稀释文库至推荐浓度(如Illumina平台需2-10 nM),结合Qubit结果与Agilent 2100生物分析仪检测片段分布。

    • 结果示例

      • 定量某NGS文库,Qubit检测浓度为4.5 ng/μL(约2.8 nM),Agilent 2100显示主峰位于350 bp,符合预期;

      • 对比紫外分光光度计(Nanodrop)结果,Qubit浓度低15%,因Nanodrop高估了RNA与蛋白质污染。

    2. 临床样本DNA定量

    • 实验设计

      1. 提取患者外周血或组织DNA,使用Qubit检测浓度;

      2. 结合qPCR验证基因拷贝数变异(如肿瘤突变负荷检测)。

    • 结果示例

      • 定量乳腺癌患者cfDNA,Qubit检测浓度为8.2 ng/μL,qPCR显示TP53突变频率为12%,与病理诊断一致;

      • 对比紫外法,Qubit浓度误差率<8%,而Nanodrop误差率达25%。

    3. 微生物DNA定量

    • 实验设计

      1. 提取细菌/病毒DNA,使用Qubit检测浓度;

      2. 结合qPCR或数字PCR分析病原载量(如病毒载量检测)。

    • 结果示例

      • 定量新冠病毒RNA提取产物,Qubit检测浓度为3.1 ng/μL(约1.9×10? copies/μL),qPCR结果与之高度相关(R2=0.98);

      • 对比紫外法,Qubit检测下限低10倍,适合低载量样本。

    三、操作规范与注意事项

    1. 实验前准备

    • 试剂配制

      1. 将试剂A与缓冲B按1:200稀释(如10 μL试剂A + 2 mL缓冲B),制备工作液;

      2. 标准品1与标准品2无需稀释,直接使用。

    • 仪器校准

      • 使用Qubit仪器时,选择“dsDNA HS Assay"程序,预热10分钟;

      • 使用酶标仪时,设置激发波长480 nm,发射波长520 nm。

    2. 检测流程

    • 标准曲线建立

      1. 取200 μL工作液分别加入2支Qubit管,加入10 μL标准品1与标准品2;

      2. 混匀后避光孵育2分钟,插入Qubit仪器检测,生成标准曲线。

    • 样品检测

      1. 取200 μL工作液加入Qubit管,加入1-20 μL样品(建议体积1 μL);

      2. 混匀后孵育2分钟,检测并记录浓度。

    3. 实验后处理

    • 废弃物处理

      • 含染料的废弃液按生物危害品处理,避免直接排放;

      • 未使用的标准品与工作液可4℃保存1周,但建议现用现配。

    • 仪器维护

      • Qubit管使用后立即丢弃,避免重复使用;

      • 酶标仪定期清洁光路,避免染料残留。

    四、常见问题解答

    Q1:Qubit检测结果与qPCR差异较大?
    A:

    1. 检查qPCR引物特异性,避免非特异性扩增;

    2. 确认Qubit检测范围(10 pg/μL-100 ng/μL),超范围样本需稀释;

    3. 对比qPCR标准曲线,确认扩增效率(90%-110%)。

    Q2:样品中含RNA或蛋白质如何处理?
    A:

    1. Qubit染料对dsDNA特异性>99%,无需额外纯化;

    2. 若需同时检测RNA,可使用Qubit RNA BR Assay Kit(货号Q32852)。

    Q3:如何延长试剂盒有效期?
    A:

    1. 试剂A避光保存于-20℃,避免反复冻融;

    2. 缓冲B与标准品4℃保存,避免高温或光照;

    3. 开封后试剂盒6个月内使用完毕。



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